Учёт летучих мышей проводился сотрудником Дарвинского запоповедника Олегом Шапкиным, специалистом по летучим мышам на северо-западе России. В учётах также принимали участие сотрудники Парка: охотовед Павел Футоран, заместитель директора по охране Евгений Буторин и начальник опергруппы Сергей Буторов.

Летучие мыши учитывались специальным прибором – ультразвуковым детектором летучих мышей (bat-детектор). Дело в том, что летучие мыши используют эхолокацию для ориентации в пространстве и для охоты на насекомых. При этом каждый вид обладает собственными характеристиками эхолокационных сигналов, благодаря чему можно различать виды рукокрылых по звукам.
В ходе экспедиции были обследованы Унская губа и северное побережье Онежского полуострова. В результате было установлено, что в национальном парке обитает только один вид – северный кожанок (Eptesicus nilssonii). Это самая северная летучая мышь, которая встречается даже в Мурманской области, а в Скандинавии её распространение достигает 70 параллели (графство Финнмарк в Норвегии), чему способствует сожительство с человеком – колонии обычно располагаются в постройках. Это единственный вид рукокрылых, который размножается за полярным кругом.
Кроме этого, была отмечена крайне редкая встречаемость летучих мышей на территории Парка – на 65 км маршрутных учётов было зарегистрировано только 11 особей северного кожанка. Отмечается, что в конце августа – в сентябре у летучих мышей проходит миграция по берегу Белого моря, так же, как и у птиц. Именно в этот период отмечается большинство наблюдений летучих мышей, сделанных местными жителями. Чтобы это выяснить, потребуется установить специальное оборудование для мониторинга активности рукокрылых в течение следующего тёплого сезона.